Загальна кількість команд-учасниць турніру – 27.
Перша стадія турніру – Попередній етап. Його учасниками є 22 команди. З них 15 команд, що не беруть участі в чемпіонаті України, та 7 команд-учасниць чемпіонату, що мають менші досягнення у Всеукраїнських змаганнях серед аматорських команд у порівнянні з іншими.
22 команди-учасниці Попереднього етапу, розподілені на пари за територіальним принципом, визначать 11 переможців, що потраплять до 1/8 фіналу розіграшу. До них приєднаються 5 команд-учасниць чемпіонату, що мають більші досягнення у Всеукраїнських змаганнях серед аматорських команд у порівнянні з іншими: "Гірник" (Соснівка Львівської обл.), "Єдність" (Плиски Чернігівської обл.), ФК "Врадіївка" (Миколаївська обл.), "ОДЕК" (Оржів Рівненської обл.), "Чайка" (Петропавлівська Борщагівка Київської обл.).
Період проведення матчів Попереднього етапу розіграшу Кубка: 31.08 – 9.10.2016 р.
Щодо дат проведення матчів 1/8 фіналу розіграшу Кубка. У зв’язку з тим, що календарем чемпіонату України не передбачено ігрових днів для проведення матчів розіграшу Кубка, крім як 24/25 та 8/9.10.2016 р., матчі 1/8 фіналу розіграшу Кубка відбудуться по середах – 19.10 та 26.10.2016 р.
Склад учасників, дати та порядок проведення матчів Попереднього етапу
31.08 – 7.09. Матчі відбулися. Переможців визначено.
"Факел" (Липовець Вінницької обл.) – "Фрунзівець" (Ніжин Чернігівської обл.) - 0:2 та 0:0
"Колос" (Хлібодарівка Херсонської обл.) - "Колос" (Зачепилівка Харківської обл.) – 0:5 та -:+
7 – 14.09
ФК "Миколаїв" (Львівська обл.) – "Случ" (Старокостянтинів Хмельницької обл.)
Перший матч – 3:0
ФК "Самбір" (Львівська обл.) – "ДСО-Поділля" (Тернопільський р-н)
Перший матч – 1:0
"Джуніорс" (Шпитьки Київської обл.) – "Патріот" (Кукавка Вінницької обл.)
Перший матч – 2:0
14 – 21.09
ФК "Бершадь" (Вінницька обл.) – "Нова Поліція" (Кропивницький)
21.09 – 2.10
"Маяк" (Сарни Рівненської обл.) – ФСК "Слобода" (Чернівецька обл.)
24.09 – 8.10
"Вікторія" (Миколаївка Сумської обл.) – "Авангард" (Корюківка Чернігівської обл.)
"Квадро" (Первомайський Харківської обл.) – "Таврія-Скіф" (Роздол Запорізької обл.)
25.09 – 8.10
ФК "Львів" – "Оскар" (Підгір’я Івано-Франківської обл.)
4 – 9.10
СКК "Демня" (Львівська обл.) – МФК "Житомир"
Перші матчі відбулися чи відбудуться на полях команд, що вказані першими.
